很多人类分子学的爱好者日常都会接触很多Y-SNP,一个snp可能对应很多名字,这就是因为各个机构命名不统一。那么我们常见的F、Y、FGC这些前缀都是哪些机构命名的呢?

A—德国柏林YSEQ.net网的Astrid 和Thomas Krahn,理学硕士

AD—科威特教育部Mohammed Al Sharija博士

AF—美国亚利桑那州图森市亚利桑那大学Fernando Mendez博士

AM或AMM—比利时鲁汶市乌兹·鲁汶的法医遗传学和分子考古学实验室

B—爱沙尼亚基因组中心

BY—美国得克萨斯州休斯顿市族谱DNA大Y检验(下一代测序)

BZ—美国得克萨斯州休斯顿市族谱DNA的Q-M242项目,以Barry Zwick命名的SNP

CTS—英国欣克斯顿Wellcome Trust Sanger研究所Chris Tyler-Smith博士

DC—Dál Cais,一个爱尔兰团体,据信是Cas, b. CE 347项目的继承者,与SNP R-L226有关;丹尼斯·赖特

DF—使用包括1000个基因组项目数据的公开全基因组序列数据的匿名研究人员,以DNA-Forums.org基因系谱学社区命名

E—Bulat Muratov

F—中国上海复旦大学金力博士

F*—中国上海复旦大学王传超、李辉(首字母为F;第二个字母为单倍群,如FI为复旦单倍群I)

FGC—美国弗吉尼亚州和马里兰州全基因组公司

G—葡萄牙波尔图大学分子病理学与免疫学研究所Verónica Gomes

GG—俄罗斯莫斯科的俄罗斯科学院通用遗传学瓦维洛夫研究所

IMS-JST—日本科学技术署医学科学研究所

JFS—约翰·斯隆

JN—雅各布·诺采特-莫伯格

K—Youngmin JeongAhn博士,学历: 首尔国立大学和亚利桑那大学

KHS—韩国生物科学与生物技术研究所功能基因组研究中心

KL—中国上海复旦大学生命科学学院与生物医学研究所现代人类学教育部重点实验室

KMS—俄罗斯科学院乌法研究中心生物科学研究所分子人类遗传学实验室Segdul Kodzhakov、Albert Katchiev、 Anatole Klyosov、Astrid Krahn、 Thomas Krahn; Bulat Muratov、Chris Morley、 Ramil Suyunov、 Vadim Sozinov、Pavel Shvarev、 SF “国家宗族DNA项目”、B.A. Muratov、EHP “Suyun” 技术科学博士、 Ramil Suyunov、 生物科学博士E.K. Khusnutdinova教授

L—族谱DNA基因组学研究中心;以已故的Leo Little命名的SNP

M—Peter Underhill,美国斯坦福大学博士

MC—美国佛罗里达大学Christopher McCown和德国柏林YSEQ.net网理学硕士Thomas Krahn

MZ—Hamma Bachir博士,E-M183项目

N—中国科学院北京生物物理研究所生物信息实验室

NWT—西北地区(Northwest Territory)的缩写,美国费城宾夕法尼亚大学分子人类学实验室Theodore G. Schurr博士

P—Michael Hammer,亚利桑那大学博士

Page, PAGES或PS—美国麻省理工学院怀特黑德生物医学研究所David C. Page

PF—意大利萨萨里大学Paolo Francalacci博士

PH—英国莱斯特大学遗传学系Pille Hallast博士

PK—巴基斯坦伊斯兰堡生物医学和基因工程实验室

PR—灵长类动物(大猩猩和黑猩猩),托马斯·克罗恩的WTTY项目。当同样的突变被发现只存在于人类时,这些突变没有命名新名字

RC—Rory Cain少校,荣誉文学士、教育学士和理学士

S—英国爱丁堡大学James F. Wilson博士

SA—南美(South America)的缩写,美国宾夕法尼亚大学分子人类学实验室西奥多·舒尔博士

SK—德国莱比锡马克斯·普朗克进化人类学研究所Mark Stoneking博士

SUR—南乌拉尔(Southern Ural)的缩写,俄罗斯科学院乌法研究中心生物化学和遗传学研究所SF “国家宗族DNA项目”、B.A. Muratov、EHP “Suyun” 技术科学博士、 Ramil Suyunov、 生物科学博士E.K. Khusnutdinova教授

TSC—美国纽约冷泉港实验室SNP协会Gudmundur A. Thorisson和Lincoln D. Stein

U—中佛罗里达大学Lynn M. Sims;Dennis Garvey,贡扎加大学博士;中佛罗里达大学Jack Ballantyne博士

V—意大利罗马第一大学“达尔文”生物学与生物技术系Rosaria Scozzari和Fulvio

VLVL—俄罗斯托木斯克国立大学Vladimir Volkov

Y—使用已发表和商业化的下一代测序样本数据的俄罗斯Y Full团队

YP—由民间科学家从基因测试中鉴定出的SNP,然后提交给Y Full团队进行验证

YSC—Thomas Krahn,理学硕士,曾任职于族谱DNA基因组学研究中心

Z—得到遗传宗谱社区支持的Gregory Magoon博士、Richard Rocca、Vince Tilroe博士、David F. Reynolds、 Bonnie Schrack、Peter M. Op den Velde Boots、Ray H. Banks、Roman Sychev、Victar Mas、Steve Fix、Christian Rottensteiner、Alexander R. Williamson博士、John Sloan、一位基于公开可得的全基因组序列数据集的匿名独立研究人员和理学硕士Thomas Krahn

ZP—使用Big Y和其他NGS来源的Peter M. Op den Velde Boots和David Stedman

ZQ—Gabit Baimbetov, Nurbol Baimukhanov“ShejireDNA项目”和该项目的其他成员

ZS—来自全基因组和大Y染色体样本的Gregory Magoon博士和Aaron Salles Torres

ZZ—Alex Williamson,回文区的突变。每个ZZ前缀表示两个可能的SNP位点

本文转载自:易刀卜的博客